کابینت های ایمنی بیولوژیکی معمولاً از سه عنصر تشکیل شده اند: پوسته بیرونی، ناحیه کار (کابینت) و سیستم فیلتر HEPA.

1. پوسته بیرونی - با استفاده از مواد مقاوم در برابر خوردگی و تمیز کردن آسان، کاربر و محیط را در برابر عوامل بیولوژیکی مضر محافظت می کند.

2. منطقه کاری (کابینت) - منطقه ای که اپراتور نمونه های بیولوژیکی را دستکاری می کند.این فیلتر توسط سیستم اگزوز هوای فیلتر HEPA احاطه شده است که مواد بالقوه عفونی و ذرات سلولی را فیلتر و حذف می کند.

3. سیستم فیلتر HEPA - فیلترهای با کیفیت بالا که در یک محفظه از جنس استنلس استیل محصور شده اند، ذرات مضر و آلاینده های میکروبی را حذف می کنند.

طراحی کلی بین سازندگان می تواند متفاوت باشد، اما تقریباً همه مدل ها شامل این سه جزء ضروری هستند.